Elektroforezės sistema susideda iš dviejų pagrindinių komponentų: maitinimo šaltinio ir elektroforezės kameros. Maitinimo šaltinis tiekia maitinimą. Šiuo atveju „galia“ yra elektra. Elektra, gaunama iš maitinimo šaltinio, teka viena kryptimi iš vieno elektroforezės kameros galo į kitą. Kameros katodas ir anodas pritraukia priešingai įkrautas daleles.
Elektroforezės kameros viduje yra padėklas, tiksliau, liejimo padėklas. Liejimo padėklas susideda iš šių dalių: stiklo plokštės, kuri patenka į liejimo padėklo dugną. Gelis laikomas liejimo dėkle. "Šukos" atrodo kaip jos pavadinimas. Šukos dedamos į angas liejimo padėklo šone. Į angas įdedamos PRIEŠ pilant karštą, ištirpusį gelį. Geliui sukietėjus, šukos išimamos. Šukų "dantys" palieka mažas skylutes gelyje, kurias vadiname "šulinėliais". Šuliniai susidaro, kai karštas, ištirpęs gelis sukietėja aplink šukų dantis. Šukos ištraukiamos po to, kai želė atvės, paliekant šulinius. Šuliniai yra vieta, kur galite įdėti daleles, kurias norite išbandyti. Žmogus turi būti labai atsargus, kad nesuardytų gelio, kraunant daleles. Tikėtina, kad gelio įtrūkimai arba lūžimas turės įtakos jūsų rezultatams.